植物染色体原位杂交技术的应用非常广泛。例如，它可以用来研究植物基因组的结构和功能，包括基因定位、染色体重组、基因表达和基因组演化等方面。此外，该技术还可以用来检测植物中的染色体异常，如染色体缺失、重复和易位等。
植物染色体原位杂交技术的优点在于它可以直接观察到染色体上的目标dna序列，而不需要进行pcr扩增或测序等操作。此外，该技术还可以同时检测多个目标dna序列，从而提高检测效率和准确性。
---原位杂交可根据其检测物而分为细胞内原位杂交和组织切片内原位杂交；根据其所用探针及所要检测---的不同又可分为dna-dna， rna-dna， rna-rna杂交。但不论哪种杂交都必须经过组织细胞的固定，预杂交，杂交，冲等一系列洗步骤及自显影或酶法显色以显示杂交结果。
我们在这儿介绍的是整胚原位杂交，不同于一般的在载片上对细胞和组织切片进行探针杂交及检测的原位杂交，
原位杂交的基本原理是利用标记的---探针与细胞或组织中的dna或rna进行杂交，gish，然后通过检测标记来识别探针的位置。这使得研究人员能够在细胞或组织中确定特定基因或基因组区域的位置和表达水平。
原位杂交可以用于多种类型的实验。例如，它可以用来检测特定基因在发育过程中的表达模式，或者确定特定基因变异在细胞中的分布。此外，原位杂交还可以用于诊断---，例如某些类型的，以及监测效果。
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