为什么不先对基因做预测,在预测的结果上直接做共定位?
不同的预测网站有不同的计算方法,同一个基因在不同的预测网站也可能得出不同的定位结果。另外所有的结果都应是基于实验得到的,对于不清楚可能定位在哪里的基因,一般先做普通定位,根据普通定位的结果再决定做哪种细胞器的共定位。
适用于什么实验场景?
(1)基因功能研究,文章里总少不了这一项。
(2)研究蛋白相互作用,与酵母双杂实验结果相互验证。
内质网
内质网是细胞中的一个复杂网络,它负责合成和转运蛋白质。为了定位内质网,我们可以使用一种名为gfp-hdel的蛋白质来标记它们。gfp-hdel是一种带有绿色荧光的蛋白质,它可以与内质网上的hdel序列结合。在洋葱细胞中,内质网通常位于细胞的中央或周围。
高尔基体
高尔基体是细胞中的另一个复杂网络,它负责合成和转运蛋白质。为了定位高尔基体,我们可以使用一种名为fm4-64的化合物来标记它们。fm4-64可以穿过细胞膜并进入高尔基体,启动子筛选,从而发出红色荧光。在洋葱细胞中高尔基体通常位于细胞的中央或周围。
除了洋葱亚细胞定位,还有许多其他亚细胞定位方法。其中,比较常见的有:
荧光法:将学方法与荧光标记技术结合起来研究特异蛋白抗原在细胞内分布的方法。由于荧光素所发的荧光可在荧光显微镜下检出,从而可对抗原进行细胞定位。用荧光技术显示和检查细胞或组织内抗原或半抗原物质等也称为荧光细胞(或组织)化学技术。
gfp融合蛋白表达法:将目的蛋白与绿色荧光蛋白(gfp)融合,通过荧光显微镜观察绿色荧光蛋白的表达位置。
亚细胞结构分离定位法。
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