原位杂交技术方法大致可分为：1.杂交前准备，包括固定、取材、玻片和组织的处理，如何增强---探针的穿透性、减低背景染色等；2.杂交；3.杂交后处理；4.显示（visualization）：包括性自显影和非性标记的显色。固定原位杂交组织化学技术在固定剂的应用和选择上应---到三个方面：保持细胞结构，限度地保持细胞内dna或rna的水平；使探针易于进入细胞或组织。dna是比较稳定的，mrna是相对稳定的但易为酶合成和降解。rna却绝然不同，非常容易被降解。因此，对于dna的定位来说，固定剂的种类和浓度并不十分重要。相反，在rna的定位上，如果要使rna的降解减少到低限度，原位杂交技术服务，那么，原位杂交检测，不仅固定剂的种类浓度和固定的时间十分重要，而且取材后应尽快予以冷冻或固定。
原位杂交技术在其他生物领域也有广泛的应用，例如：
动物行为学研究：在动物行为学中，原位杂交技术可以用于检测动物行为与基因表达之间的关系。例如，原位杂交公司，通过比较不同行为状态下动物脑组织中基因表达的差异，可以揭示特定基因对动物行为的影响。
生物技术应用：原位杂交技术在生物技术领域也有广泛应用，例如在基因、基因编辑和开发等方面。例如，通过原位杂交技术可以定位和特定基因，原位杂交，为基因和基因编辑提供基础数据和工具。
原位杂交是在分子生物学领域应用---广泛的实验技术之一，是在研究生物体发育过程中的一种---重要的分子遗传学的研究方法。其英文名为in situ hybridization，其中in situ为拉丁文，原义是in its natural ition. 字面的意思理解就是说在其原来的天然的位置处杂交。原位杂交主要是基于以下这个主要原理：单链的dna或者rna只要他们的序列是互补的，即符合at，cg的碱基配对原则，那么这样的两条---链之间（dna-dna，dna-rna，rna-rna）就可以形成一个稳定的杂交复合体。
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