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植物组织原位杂交的步骤包括以下几个方面：

1. 制备组织样品：从植物中取出需要研究的组织样品，如根、茎、叶等。

2. 固定组织样品：将组织样品固定在载玻片上，通常使用或---等化学物质进行固定。

3. 处理组织样品：对固定的组织样品进行脱水、透明化、脱脂等处理，以便于dna探针的穿透和结合。

4. 制备dna探针：根据需要研究的基因序列，设计并合成dna探针。dna探针可以标记荧光染料或性同位素，以便于检测。

5. 杂交dna探针：将dna探针与组织样品进行杂交，通常需要在高温下进行，以便于dna探针与rna或dna结合。

6. 检测杂交信号：通过荧光显微镜或计数器等设备，检测dna探针与rna或dna的结合情况，gish，确定目标基因的表达模式和位置。

植物原位杂交在遗传育种方面的应用主要包括：

异源染色质及多种染色体畸变检测：通过远缘杂交把有用遗传物质基因的异源染色质渐渗到植物中。如带有几种抗病基因的黑麦1r染色体已被整合到许多高产的小麦品种中。原位杂交技术则是鉴定外源染色体(质)的有效手段。

基因组印记研究：基因组印记是指一个基因的两条染色体上的dna序列存在差异。通过植物原位杂交技术，可以检测到基因组印记的存在和分布，从而帮助确定基因组的进化、遗传和功能特征。