这一原理对于检测一个特异的mrna在某一种生物体，原位杂交服务，或者某些组织切片、单个细胞里具体表达位置非常有用。该技术早应用于60年代末期，由于---分子杂交的特---高，并可定位，因此该技术已被广泛应用，例如与细胞内rna进行杂交以观察该组织细胞中特定基因表达水平。原位杂交能在成分复杂的组织中进行单一细胞的研究而不受同一组织中其他成分的影响，因此对于那些细胞数量少且散在于其他组织中的细胞内dna或rna研究更为方便；同时由于原位杂交不需要从组织中提取---，对于组织中含量极低的靶序列有---的敏感性，荧光原位杂交，并可完整地保持组织与细胞的形态，更能准确地反映出组织细胞的相互关系及功能状态。
原位杂交技术(in situ hybridization，ish)是分子生物学、组织化学及细胞学相结合而产生的一门新兴技术，原位杂交，始于20世纪60年代。1969年美国耶鲁大学的gall等(1969)首先用爪蟾核糖体基因探针与其卵母细胞杂交，将该基因进行定位，与此同时buongiorno—nardelli和amaldi等(1970)相继利用同位素标记---探针进行了细胞或组织的基因定位，从而创造了原位杂交技术。自此以后，由于分子生物学技术的迅猛发展，---是20世纪70年代末到80年代初，分子、质粒和噬菌体dna的构建成功，植物原位杂交，为原位杂交技术的发展奠定了深厚的技术基础。
原位杂交技术可以应用于以下场景：
组织中---dna/rna的检测和定位。例如，可以用于检测eb---mrna、人类状瘤---和巨细胞---dna等。
癌基因、抑癌基因及其他各种功能基因在转录水平的表达及其变化的检测。
检测染色体的变化，如染色体数量异常和染色体易位等。
在植物基因组研究中的应用。例如，通过与特定基因序列的探针进行杂交，可以在植物染色体上定位到目标基因的位置，进而构建遗传图谱，为植物育种和基因组研究提供基础数据。
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