透射电子显微镜透射电子显微镜是一种高分辨率的亚细胞定位方法，它可以通过观察细胞超微结构来确定目标蛋白质的位置。这种方法需要制备样品，但可以提供更直观的细胞结构信息。原子力显微镜原子力显微镜是一种可以在纳米水平上观察细胞表面的亚细胞结构的技术。它可以通过检测样品表面的原子相互作用来形成高分辨率的图像。这种方法不需制备样品，可在自然状态下观察细胞表面结构。
除了洋葱亚细胞定位，bifc，还有许多其他亚细胞定位方法。其中，比较常见的有：
荧光法：将学方法与荧光标记技术结合起来研究特异蛋白抗原在细胞内分布的方法。由于荧光素所发的荧光可在荧光显微镜下检出，从而可对抗原进行细胞定位。用荧光技术显示和检查细胞或组织内抗原或半抗原物质等也称为荧光细胞(或组织)化学技术。
gfp融合蛋白表达法：将目的蛋白与绿色荧光蛋白(gfp)融合，通过荧光显微镜观察绿色荧光蛋白的表达位置。
亚细胞结构分离定位法。
为什么要提供gfp空载的对照图片？
（1）作为整个实验过程中的操作参照，可排除因实验操作而导致目的基因没有荧光信号的影响。
（2）作为载体体系的参照，确认构建载体时所使用的载体是可正常表达荧光蛋白的。
拍摄时为什么有明场通道？
（1）显示细胞状态，有活力的细胞应该有正确且明显的细胞形态，变形或破碎的细胞说明此时细胞不是适状态或细胞已。
（2）显示荧光确实是细胞内蛋白表达的，而不是细胞碎片及杂质产生的杂光。
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