在原位杂交过程中，需要使用标记的---探针，原位杂交检测，通常是在性核素或非性物质中标记的。这些探针可以通过不同的方式制备，例如从已知序列的dna或rna制备，或者通过使用生物信息学方法设计和合成新的探针。
在进行原位杂交时，细胞或组织需要固定在适当的支持物上，例如载玻片。然后，探针与细胞或组织中的dna或rna进行杂交，通常是在加热条件下进行的。接下来，通过洗涤和显影步骤去除未结合的探针和信号增强剂，原位杂交技术，后用显微镜观察杂交信号的位置。
一. 原位杂交天
1. 重新水化和固定
1） 吸取固定好的胚胎，加入50%的pbst溶液，放置5分钟。
2） 置换成30％的pbst溶液，放置5分钟
3） 置换成pbst溶液，放置5分钟，重复一次
4） 置换成4％---的pbs溶液固定20分钟
5） 用pbst洗两次，每次放置五分钟，动物组织原位杂交，室温。
蛋白酶处理与后固定（本实验不做此步）
1） 用10ul/ml的蛋白酶k在室温下处理胚胎。5体节以下的胚胎不处理，5体节到24小时的胚胎处理3分钟，24小时以上的胚胎处理5分钟或者更长。发育时间越短的胚胎越嫩，可以不用或者少用蛋白酶处理，原位杂交，发育时间长的胚胎就需要用蛋白酶来疏松组织，以便于杂交。
2） 用pbst溶液轻洗，在pbst中放置5分钟。
3） 用4％---的pbs溶液固定20分钟，室温。
4） 用pbst洗两次，每次放置五分钟，室温。
细胞特---mrna转录的定位，可用于基因图谱，基因表达和基因组进化的研究；组织中---dna/rna的检测和定位，如eb---mrna、人类状瘤---和巨细胞---dna的检测；癌基因、抑癌基因及各种功能基因在转录水平的表达及其变化的检测；基因在染色体上的定位；检测染色体的变化，如染色体数量异常和染色体易位等；分裂间期细胞遗传学的研究，如遗传病的产前诊断和某些遗传病基因携带者的确定，某些的诊断和生物学剂量测定等。
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