武汉贝科新肽-植物启动子筛选

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    2023-12-16

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构建亚细胞定位载体时,gfp融合位置为什么有n端、c端之分?

若序列中存在信号肽,则构建载体时需避开这一端来融合荧光蛋白。需注意不同的融合方式可能会得到不同的定位结果,例如融合在荧光蛋白n端的目标蛋白一般无法得到---化物酶体的定位结果;融合在荧光蛋白c端的目标蛋白一般无法得到线粒体、质体的定位结果。







为什么不同的受体材料有时得到的定位结果不一样?

不同物种的细胞在翻译表达基因时,其表达模式和影响因子不同。受物种差异的影响,同一个载体在不同的受体材料中表达的位置可能不同,因此建议实验时尽可能选用与目的基因来源相近的受体材料进行表达。



为什么不先对基因做预测,在预测的结果上直接做共定位?

不同的预测网站有不同的计算方法,同一个基因在不同的预测网站也可能得出不同的定位结果。另外所有的结果都应是基于实验得到的,对于不清楚可能定位在哪里的基因,一般先做普通定位,根据普通定位的结果再决定做哪种细胞器的共定位。

适用于什么实验场景?

(1)基因功能研究,文章里总少不了这一项。

(2)研究蛋白相互作用,与酵母双杂实验结果相互验证。




在预测阶段,研究人员会利用机器学习算法和已知的基因表达数据来训练模型,植物启动子筛选,从而识别出可能与特定基因表达相关的启动子序列。这些预测的启动子序列将被用作进一步实验的基础。

在实验验证阶段,研究人员会将这些预测的启动子序列与报告基因(如荧光蛋白)一起插入植物的基因组中,然后观察报告基因的表达情况。如果报告基因的表达模式与预期相符,那么就可以认为这个启动子在促进特定基因的表达方面起着关键作用。






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