这一原理对于检测一个特异的mrna在某一种生物体，或者某些组织切片、单个细胞里具体表达位置非常有用。该技术早应用于60年代末期，由于---分子杂交的特---高，并可定位，动物组织原位杂交，因此该技术已被广泛应用，例如与细胞内rna进行杂交以观察该组织细胞中特定基因表达水平。原位杂交能在成分复杂的组织中进行单一细胞的研究而不受同一组织中其他成分的影响，因此对于那些细胞数量少且散在于其他组织中的细胞内dna或rna研究更为方便；同时由于原位杂交不需要从组织中提取---，对于组织中含量极低的靶序列有---的敏感性，ish，并可完整地保持组织与细胞的形态，更能准确地反映出组织细胞的相互关系及功能状态。
原位杂交（in situ hybridazation）
固定
收集斑马鱼的胚胎，在holfretor水中培养，原位杂交试剂，到达所需要的发育时期时，用蛋白酶去除卵膜，用4%---固定，在4℃保存，二十四小时后用50%2%---溶液洗，然后换成，在-20c 保存，原位杂交，待用(两天和两天以上的胚胎需要用处理，去除色素。或者使用---锍脲稀溶液培养，可阻断色素的形成)
把滤膜放在纸巾上于室温晾干后，把滤膜（编号面朝上）放在一张保鲜膜上，并在保鲜膜上作几个不对称的标记，以使滤膜与性自显影片位置对应。
用第二张保鲜膜盖住滤膜。加光片并加上增感屏于-70℃---12-16小时。
底片显---，在底片上贴一张透明硬纸片。在纸上标记阳性杂交信号的位置，同时在不对称分布点的位置上作出标记。可从底片上取下透明纸，通过对比纸上的点与琼脂上的点来鉴定阳性菌落。
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