在ishh，整个实验周期是比较长的，实验程序也比较繁杂，而杂交在ishh整个实验中可被认为是“短兵相接”的一步。杂交前的一切准备工作如增加组织通透性都是为了在杂交这一步骤中---探针能进入细胞或组织与其内的靶核苷酸相结合。因此，杂交是ishh中关键的而且是重要的一个环节。杂交是将杂交液滴于切片组织上，加盖硅化的盖玻片，防止孵育过程中的高温（50℃左右）导致杂交液的蒸发。为---杂交所需的湿润环境，可将其放在盛有少量5×ssc或2×ssc（standard saline citrate， ssc）溶液的硬塑料盒中进行孵育。杂交液的成分和预杂交液基本相同，所不同的是加入了标记的---探针和---葡聚糖。
原位杂交技术是一种在生物组织或细胞中定位dn---段或rna序列的重要生物技术，具有广泛的应用前景。该技术在医学、农业和工业等领域都有广泛的应用，可以帮助人们深入理解基因表达和遗传特征，为---的诊断和、品种的鉴定和遗传育种以及产品安全性和稳定性的检测提供有效手段。随着科技的不断发展，原位杂交技术的应用前景将广阔，为生命科学和医学等领域的研究提供更多可能性。
原位杂交第三天
1） 用1ml含10％热灭清的mabt溶液置换溶液，gish，放置摇床上25分钟，然后用1mlmabt置换，25分钟，再用1mlmabt溶液置换，一小时以上，后用1mlmabt溶液置换，25分钟。
2） 用1ml 1mm左旋米睉的staining buffer洗三次，每次放置五分钟。
3）将胚胎转入十六孔板中，吸去staining buffer，加上300ul bm purple ap substrate(底物，用之前加5mm左旋米唑)，十六孔板外面包上锡箔纸以避光，避免摇动，室温下显色。
4）每隔一小时观察胚胎是否开始显色
5）将显色完全的胚胎中的底物吸出，用pbst洗两三次后加上4％---固定，拍照。
6）4c冰箱保存。
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