细胞特---mrna转录的定位，可用于基因图谱，基因表达和基因组进化的研究；组织中---dna/rna的检测和定位，如eb---mrna、人类状瘤---和巨细胞---dna的检测；癌基因、抑癌基因及各种功能基因在转录水平的表达及其变化的检测；基因在染色体上的定位；检测染色体的变化，如染色体数量异常和染色体易位等；分裂间期细胞遗传学的研究，如遗传病的产前诊断和某些遗传病基因携带者的确定，某些的诊断和生物学剂量测定等。
荧光原位杂交(fluorescence in situ hybridization，fish）是在20世纪80年代末在性原位杂交技术的基础上发展起来的一种非性分子细胞遗传技术，以荧光标记取代同位素标记而形成的一种新的原位杂交方法，原位杂交，探针首先与某种介导分子（reporter molecule）结合，杂交后再通过细胞化学过程连接上荧光染料.fish的基本原理是将dna（或rna）探针用特殊的核苷酸分子标记，然后将探针直接杂交到染色体或dna纤维切片上，动物组织原位杂交，再用与荧光素分子偶联的单与探针分子特---结合来检测dna序列在染色体或dna纤维切片上的定性、定位、相对定量分析.fish具有安全、快速、灵敏度高、探针能长期保存、能同时显示多种颜色等优点，不但能显示中期分裂相，还能显示于间期核.同时在荧光原位杂交基础上又发展了多彩色荧光原位杂交技术和染色质纤维荧光原位杂交技术.
植物组织原位杂交的步骤包括以下几个方面：
1. 制备组织样品：从植物中取出需要研究的组织样品，如根、茎、叶等。
2. 固定组织样品：将组织样品固定在载玻片上，荧光原位杂交，通常使用或---等化学物质进行固定。
3. 处理组织样品：对固定的组织样品进行脱水、透明化、脱脂等处理，以便于dna探针的穿透和结合。
4. 制备dna探针：根据需要研究的基因序列，设计并合成dna探针。dna探针可以标记荧光染料或性同位素，以便于检测。
5. 杂交dna探针：将dna探针与组织样品进行杂交，通常需要在高温下进行，以便于dna探针与rna或dna结合。
6. 检测杂交信号：通过荧光显微镜或计数器等设备，检测dna探针与rna或dna的结合情况，确定目标基因的表达模式和位置。
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