预杂交
1）每个管中置换成大约300ulhyb－溶液，60℃水浴5分钟，避免振荡。
2）用等体积的hyb＋取代hyb－。
3）60℃水浴，预杂交4小时以上。
杂交
1）吸去预杂交的hyb＋，加上100ul已加入探针的hyb＋溶液（探针浓度约为1ng/ul）..
2）60℃ 温浴过夜。
注：杂交与预杂交的温度可以是55到60度不等，温度越低，探针结合越好，温度越高，背景越小。
在ishh，整个实验周期是比较长的，实验程序也比较繁杂，植物原位杂交，而杂交在ishh整个实验中可被认为是“短兵相接”的一步。杂交前的一切准备工作如增加组织通透性都是为了在杂交这一步骤中---探针能进入细胞或组织与其内的靶核苷酸相结合。因此，杂交是ishh中关键的而且是重要的一个环节。杂交是将杂交液滴于切片组织上，原位杂交服务，加盖硅化的盖玻片，防止孵育过程中的高温（50℃左右）导致杂交液的蒸发。为---杂交所需的湿润环境，可将其放在盛有少量5×ssc或2×ssc（standard saline citrate， ssc）溶液的硬塑料盒中进行孵育。杂交液的成分和预杂交液基本相同，所不同的是加入了标记的---探针和---葡聚糖。
原位杂交的基本原理是利用标记的---探针与细胞或组织中的dna或rna进行杂交，然后通过检测标记来识别探针的位置。这使得研究人员能够在细胞或组织中确定特定基因或基因组区域的位置和表达水平。
原位杂交可以用于多种类型的实验。例如，它可以用来检测特定基因在发育过程中的表达模式，或者确定特定基因变异在细胞中的分布。此外，原位杂交，原位杂交还可以用于诊断---，例如某些类型的，以及监测效果。
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