原位杂交（in situ hybridization）是指将特定标记的已知---序列为探针与细胞或组织切片中---进行杂交，从而对特定---序列进行定量定位的过程。这个技术可以用于研究细胞或组织中特定基因或dna序列的表达和定位，从而帮助研究者深入理解和探究生物学过程。原位杂交有几种不同的类型，包括荧光原位杂交和其他用于基因表达分析的方法。
这一原理对于检测一个特异的mrna在某一种生物体，或者某些组织切片、单个细胞里具体表达位置非常有用。该技术早应用于60年代末期，由于---分子杂交的特---高，并可定位，因此该技术已被广泛应用，例如与细胞内rna进行杂交以观察该组织细胞中特定基因表达水平。原位杂交能在成分复杂的组织中进行单一细胞的研究而不受同一组织中其他成分的影响，因此对于那些细胞数量少且散在于其他组织中的细胞内dna或rna研究更为方便；同时由于原位杂交不需要从组织中提取---，对于组织中含量极低的靶序列有---的敏感性，并可完整地保持组织与细胞的形态，更能准确地反映出组织细胞的相互关系及功能状态。
荧光原位杂交（fish）技术具有以下优点：
高特---：荧光探针的合成是定向的，---了杂交过程的特---，可以有效地降低非特---杂交和背景干扰。
高灵敏度：荧光信号的检测比性信号的检测更灵敏，可以检测出低拷贝数的dna序列，染色体原位杂交，甚至可以检测单个基因序列。
快速简便：fish技术操作简便，杂交过程可以在数小时或数天内完成，而且不需要过于复杂的设备，便于在实验室开展。
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