细胞特---mrna转录的定位，可用于基因图谱，基因表达和基因组进化的研究；组织中---dna/rna的检测和定位，如eb---mrna、人类状瘤---和巨细胞---dna的检测；癌基因、抑癌基因及各种功能基因在转录水平的表达及其变化的检测；基因在染色体上的定位；检测染色体的变化，如染色体数量异常和染色体易位等；分裂间期细胞遗传学的研究，如遗传病的产前诊断和某些遗传病基因携带者的确定，某些的诊断和生物学剂量测定等。
原位杂交技术（in situhybridization）是以标记的---分子为探针，在组织细胞原位检测特异---分子的技术。使含有特异序列、经过标记的---单链即探针，在适宜条件下与组织细胞中的互补---单链即靶---发生杂交，gish，再以自显影或细胞化学方法对标记探针进行探测，从而在细胞原位显示特异的dna或rna分子。
可以检测crna、mirna、lnrna、dna。可以各种种属的标本，包括哺乳动物、爬行动物、菌、植物标本。也可以检测组织芯片。
dna 探针为原位杂交提供较高的灵敏度。与rna探针相比，dna探针与靶mrna 分子的杂交强度较弱，因此在杂交后的洗涤中不应使用甲醛。
探针特------。如果已知细胞中mrna或dna的确切核苷酸序列，则可据此设计高度的互补探针。如果超过 5% 的碱基对不互补，那么探针只能与靶序列发生轻度杂交。这意味着，探针更容易在洗涤和检测步骤中被洗去，可能无---确检测。
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