原位杂交是在分子生物学领域应用---广泛的实验技术之一，是在研究生物体发育过程中的一种---重要的分子遗传学的研究方法。其英文名为in situ hybridization，其中in situ为拉丁文，原义是in its natural ition. 字面的意思理解就是说在其原来的天然的位置处杂交。原位杂交主要是基于以下这个主要原理：单链的dna或者rna只要他们的序列是互补的，即符合at，cg的碱基配对原则，那么这样的两条---链之间（dna-dna，dna-rna，rna-rna）就可以形成一个稳定的杂交复合体。
原位杂交法是指将特定标记的已知顺序---为探针与细胞或组织切片中---进行杂交，从而对特定---顺序进行定量定位的方法。原位杂交法可以在细胞标本或组织标本上进行。另有荧光原位杂交使用dna或者rna探针来检测与其互补的另一条链在---或其他真核细胞中的位置rna原位---杂交又称rna原位杂交组织化学或rna原位杂交。
在原位杂交过程中，需要使用标记的---探针，gish，通常是在性核素或非性物质中标记的。这些探针可以通过不同的方式制备，例如从已知序列的dna或rna制备，或者通过使用生物信息学方法设计和合成新的探针。
在进行原位杂交时，细胞或组织需要固定在适当的支持物上，例如载玻片。然后，探针与细胞或组织中的dna或rna进行杂交，通常是在加热条件下进行的。接下来，通过洗涤和显影步骤去除未结合的探针和信号增强剂，后用显微镜观察杂交信号的位置。
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