根据---探针标记物的种类分别进行自显影或利用酶检测系统进行不同显色处理。细胞或组织的原位杂交切片在显示后均可进行半定量的测定，如自显影可利用人工或计算机辅助的图象分析检测仪（computer-assisted image ---ysis）检测银粒的数量和分布的差异。非性---探针杂交的细胞或组织可利用酶检测系统显色，然后利用显微分光光度计或图像分析仪对不同类型和数量的---的显色强度进行检测。
植物原位杂交除了在遗传育种方面的应用，还在其他领域有着广泛的应用，gish，包括：
植物基因研究：植物基因是一种利用基因工程技术来人类遗传---的方法。通过植物原位杂交技术，可以将人类基因导入到植物细胞中，并在植物细胞中表达出相应的蛋白质，为基因提供重要的物质基础。
植物抗性研究：植物原位杂交技术可以用于研究植物对环境---的抗性机制，例如抗旱、抗盐、抗病等，有助于了解植物在环境---下的生理和分子响应机制。
植物比较研究：通过植物原位杂交技术可以比较不同植物之间基因表达模式的差异，从而为植物分类和进化研究提供重要的参考依据。
原位杂交技术(in situ hybridization，ish)是分子生物学、组织化学及细胞学相结合而产生的一门新兴技术，始于20世纪60年代。1969年美国耶鲁大学的gall等(1969)首先用爪蟾核糖体基因探针与其卵母细胞杂交，将该基因进行定位，与此同时buongiorno—nardelli和amaldi等(1970)相继利用同位素标记---探针进行了细胞或组织的基因定位，从而创造了原位杂交技术。自此以后，由于分子生物学技术的迅猛发展，---是20世纪70年代末到80年代初，分子、质粒和噬菌体dna的构建成功，为原位杂交技术的发展奠定了深厚的技术基础。
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