植物原位杂交除了在遗传育种方面的应用，还在其他领域有着广泛的应用，包括：
植物基因表达模式研究：通过植物原位杂交技术可以检测特定基因在不同组织或不同生长条件下的表达模式，有助于了解基因的功能和作用机制。
植物基因组研究：植物原位杂交技术可以用于基因组研究，例如染色体构象、基因组变异和基因组进化等方面，有助于深入了解植物基因组的特征和结构。
原位杂交是在分子生物学领域应用---广泛的实验技术之一，是在研究生物体发育过程中的一种---重要的分子遗传学的研究方法。其英文名为in situ hybridization，其中in situ为拉丁文，原义是in its natural ition. 字面的意思理解就是说在其原来的天然的位置处杂交。原位杂交主要是基于以下这个主要原理：单链的dna或者rna只要他们的序列是互补的，即符合at，cg的碱基配对原则，那么这样的两条---链之间（dna-dna，dna-rna，rna-rna）就可以形成一个稳定的杂交复合体。
原位杂交第二天
1.
1）将探针回收，放于－20c保存(通常探针可重复使用十次左右)。
2）加入50%---胺/2xssct溶液1毫升，60℃，放置30分钟，重复一次。
3）置换2xssct1ml，60℃，放置15分钟。
4）置换0.2xssct1ml，60℃，放置30分钟，重复一次。
2.
1）用mabt洗两次，每次五分钟，gish，放在摇床轻轻摇动。
2）室温下加1ml 1：2：7溶液，时间为一小时。
3）按1：3000的比例在1：2：7溶液中加入酶连，4c 冰箱过夜。
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