原位杂交技术是在一定的温度和离子浓度下，使具有特异序列的单链探针通过碱基互补规则与组织细胞内待测的---复性结合而使得组织细胞中的特------得到定位，并通过探针上所标记的检测系统将其在---的原有位置上显示出来。经特定标记的核苷酸链为探针，可与组织切片、细胞或染色体标本中的待检dn---段或mrna进行杂交，然后显示标记物，从而分析待检---的分布和含量。利用此项技术可研究各种基因在染色体上的定位，编码某种蛋白质的mrna在胞质中的表达。
这一原理对于检测一个特异的mrna在某一种生物体，或者某些组织切片、单个细胞里具体表达位置非常有用。该技术早应用于60年代末期，染色体原位杂交，由于---分子杂交的特---高，并可定位，因此该技术已被广泛应用，例如与细胞内rna进行杂交以观察该组织细胞中特定基因表达水平。原位杂交能在成分复杂的组织中进行单一细胞的研究而不受同一组织中其他成分的影响，因此对于那些细胞数量少且散在于其他组织中的细胞内dna或rna研究更为方便；同时由于原位杂交不需要从组织中提取---，对于组织中含量极低的靶序列有---的敏感性，并可完整地保持组织与细胞的形态，更能准确地反映出组织细胞的相互关系及功能状态。
和其它实验方法一样，必须同时设对照试验以证明其实验结果特---。对照试验的设置须根据---探针和靶核苷酸的种类和现有的可能条件去选定。ishh的优点是它的高度特---，它可测定组织、培养的单个细胞或细胞提取物中的核苷酸含量。应用高敏感度的性标记crna探针在理想的ishh的实验条件下检测mrna，其敏感度可达到20个mrna拷贝/每个细胞。由于双链dna的稳定性，在用ishh定位dna时很少发生丢失，降解，其敏感性高到能够显示在染色体铺片上，有时甚至在组织切片上的单个基因拷贝。正因为如此，对ishh结果的解释应持慎重态度，---是前人未报告过的新发现。
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